1. Рабочая группа по таможенному декларированию
2. Рабочая группа по вопросам применения таможенной процедуры временного ввоза (допуска)
3. Рабочая группа по вопросам совершенствования таможенных операций в отношении товаров для личного пользования, перемещаемых физическими лицами
4. Рабочая группа по совершенствованию порядка совершения таможенных операций в отношении экспресс-грузов и международных почтовых отправлений
5. Рабочая группа по развитию института уполномоченного экономического оператора в государствах – членах Евразийского экономического союза
6. Рабочая группа по выработке комплекса мер по борьбе с ввозом на таможенную территорию Евразийского экономического союза и последующим оборотом нелегальной табачной и никотинсодержащей продукции на рынке Евразийского экономического союза
7. Рабочая группа по разработке системы электронного обмена информацией в целях реализации Соглашения об обмене информацией о товарах и транспортных средствах международной перевозки, перемещаемых через таможенные границы Евразийского экономического союза и Китайской Народной Республики, от 6 июня 2019 года
8. Рабочая группа по разработке системы электронного обмена информацией в целях реализации статьи 7.7 Временного соглашения, ведущего к образованию зоны свободной торговли между Евразийским экономическим союзом и его государствами-членами, с одной стороны, и Исламской Республикой Иран, с другой стороны, от 17 мая 2018 года
9. Рабочая группа по разработке системы электронного обмена таможенной информацией с Республикой Узбекистан
10. Экспертная группа по развитию интегрированной информационной системы Союза в части общих процессов в таможенной сфере
11. Экспертная группа по вопросам таможенных платежей
12. Экспертная группа по вопросам таможенной стоимости
13. Экспертная группа по вопросам происхождения товаров
14. Экспертная группа по таможенным классификаторам
15. Экспертная группа по разработке структур и форматов таможенных документов и сведений, представляемых в электронной форме
16. Экспертная группа по разработке временных интеграционных технических решений при перевозках с применением навигационных пломб