Бөлім келесі функцияларды орындайды:
1) ішкі нарықтағы алып қоюларды анықтау және тоқтату жөніндегі жұмыстарды жүргізеді;
2) iшкi нарықта жұмыс iстейтiн тауарлардың өзара саудасындағы босатулар тiзiлiмiн және шектеулер тiзiлiмiн қалыптастыру және жүргiзу жөнiндегi жұмысты қамтамасыз етедi;
3) жеңілдіктермен жұмыс істеудің әдістемелік негіздерін әзірлеуге қатысады;
4) мүдделі тараптарға алып қоюларды тоқтату туралы ақпарат береді;
5) ішкі нарықтың жұмыс істеуіне кедергілердің әсеріне экономикалық талдау жүргізеді;
6) Департаменттің құзыретіне кіретін мәселелер бойынша жұмыс (сараптама) топтарының қызметін ұйымдастырушылық қамтамасыз етуді жүзеге асырады;
7) Департаменттің құзыретіне жатқызылған мәселелер бойынша Комиссияның ғылыми-зерттеу жұмыстарының жоспарына қосу үшін ұсыныстар әзірлейді және береді;
8) талдаудың әртүрлі әдістерін пайдалана отырып, кедергілерді анықтау бойынша ғылыми-зерттеу жұмыстарын орындау процесін ұйымдастырады;
9) бөлімнің құзыретіне кіретін мәселелер бойынша Комиссияның құрылымдық бөлімшелерімен, мүше мемлекеттердің мемлекеттік органдарымен өзара іс-қимыл жасайды.
10) ішкі нарықтың жұмыс істеуі мәселелері бойынша бизнес-қауымдастықпен өзара әрекеттесуді ұйымдастырады;
11) қызмет ету мәселелері бойынша жиынтық және есеп беру жұмысын жүргізеді.